过滤是每个鱼缸必备神奇。因残食，排泄物，腐草，以及其他有机物颗粒残留在水族箱内会造成水质透明度的降低，影响水草的光合作用。消耗大量的氧气导致鱼儿抗病能力下降。
因此，必须要及时出去水中的有害物质，最有效的方法就是通过过滤泵进行过滤。
按照过滤原理来分，有物理过滤，生物过滤，化学过滤三种方法。
物理过滤：物理过滤是用过滤棉等材料，将有机物颗粒残留通过人工清洗来处理。
生物过滤：主要是利用光合细菌，硝化细菌等，目前用的比较多的是使用体积，水流速度，温度均较适合的过滤材料，入生化棉，塑料生化球，陶瓷环，珊瑚沙来进行过滤。过滤材料的共同特点是有微小的空隙，而细菌就附着在这些空隙内壁。
当含有有害物质的水流过时，过滤材料会将有害物质降解成低毒或无毒性的物质，从而起到净化水质的作用。
化学过滤：化学过滤是以化学方式来去除水体中对鱼儿有害的物质，活性炭的水处理也属于化学过滤，是通过吸附作用去除水体中的有害物质。
在实际使用过程中，以上三种方式互相关联不可分割，比如在生化过滤的同时，过滤材料又担当物理过滤的角色
滤材的选择
过滤棉：主要是物理过滤，特点之地相对于其他滤材比较细密，水流经过过滤棉时可将水中的有机颗粒截留，因此要经常清洗。
陶瓷环：利用陶瓷之地的小环进行过滤，市场上形状多种多样，陶瓷环要用不易破碎，空隙细密，质地均匀，透气性好。
活性炭：一般活性炭是利用碳粉压制而成，内部有很多细微小孔，有很强的吸附作用，可去除水体中的微小颗粒，对水中异味，颜色去除有良好的效果，但是不宜作为第一道滤材，应该放在最后一道，使用时要放在塑料网套内，然后再放入过滤器中，第一次清洗后，要放在太阳下暴晒，然后再用清水清洗，去除摩擦产生的粉末后再使用。
过滤器的种类，有内置过滤器，溢流式过滤器，底部过滤器，上部过滤器，外置式过滤器
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